Вторая часть франшизы «Мастер Муси» продолжает историю странника Гинко, специалиста по изучению мифических духов муси — сущностей, являющихся воплощением мировой жизненной энергии, которые незримы для большинства людей, но способны кардинально влиять на их судьбу, здоровье и даже жизнь целых поселений.
Действие аниме разворачивается в мире, где наряду с привычными растениями и животными существуют загадочные создания муси, невидимые для обычных людей и влияющие на их жизнь неощутимым образом: они могут вызывать странные болезни, портить урожай, становиться причиной необъяснимых несчастий или древних семейных проклятий.