Завершение многолетней истории братьев Эдварда и Альфонса Элриков, которые начали свой путь еще в детстве, после того как неудачная попытка человеческой трансмутации отняла у них тела и поставила перед целью вернуть себе нормальную жизнь. Эта полнометражная работа объединяет сюжетные арки последних сезонов оригинального аниме, закрывая все оставшиеся незавершенные сюжетные линии и раскрывая...
Действие фильма разворачивается в 1614 году, когда Япония только завершила объединение под властью первого сёгуна Токугавы Иэясу. Кланы ниндзя Кога и Ига, которые ведут беспощадную войну на протяжении сотен лет, вынуждены смириться с перемирием, навязанным новым правителем. Но даже официальное прекращение огня не может стереть из памяти поколениям взаимные обиды и кровь.