Сериал «Школьные духи» сочетает в себе черты подростковой драмы, мистического фэнтези и классического детективного сюжета. История разворачивается в обычной американской школе, где после внезапной и необъяснимой смерти старшеклассницы Мэдди она обнаруживает, что осталась призраком, при этом только она и несколько других недавно умерших подростков могут видеть и слышать друг друга.
История разворачивается вокруг Кайры, обычной девочки-подростка из тихого городка Ривер Сити, которая раньше и не подозревала о существовании магического мира, скрытого от глаз обычных людей. Всё меняется в один обычный день, когда она случайно прикасается к древней магической книге — в результате неожиданного происшествия Кайра превращается в трилинга, существо, сочетающее в себе черты...