События аниме-сериала разворачиваются в середине XX века, когда тринадцатилетний Порфирасу «Порфи» Патагос живет спокойной размеренной жизнью в небольшой деревне недалеко от греческого города Янина. Он помогает отцу в небольшом гараже, мечтая в будущем продолжить его дело и работать с автомобилями, а его младшая сестра Мина занимается пением и мечтает стать певицей.
Действие разворачивается в мрачном альтернативном средневековье, где человеческие поселения постоянно подвергаются нападениям опасных оборотней ёма — чудовищ, способных принимать облик своих жертв и завладевать их памятью после того, как съедят их мозг. Для защиты людей тайная Организация создала специальный отряд воительниц, известных как Клеймор: полулюдей, в чьи тела введена кровь и плоть...