Мир, в котором разворачивается действие «Бунраку», живет по своим правилам: после глобальной войны центральная власть рухнула, и крупные города оказались под контролем жестоких банд головорезов, которые грабят жителей, устанавливают свои законы и не боятся наказания. В один из таких городов, где каждый день может стать последним, прибывают два незнакомца с совершенно разными целями.
Действие фильма разворачивается в 1942 году, когда механизм массового уничтожения евреев и других узников концлагерей работает в полную силу. Главный герой — нацистский офицер Курт Герстейн, который сначала выполнял служебные обязанности в системе Третьего рейха, но после личного ознакомления с процессом газовых камер потрясен до глубины души масштабами преступлений, в которых он косвенно...